Teori Dan Tutorial Molecular Docking Menggunakan Autodock Vina
Download Teori Dan Tutorial Molecular Docking Menggunakan Autodock Vina PDF/ePub or read online books in Mobi eBooks. Click Download or Read Online button to get Teori Dan Tutorial Molecular Docking Menggunakan Autodock Vina book now. This website allows unlimited access to, at the time of writing, more than 1.5 million titles, including hundreds of thousands of titles in various foreign languages.
Teori dan Tutorial Molecular Docking Menggunakan AutoDock Vina
Autodock Vina adalah perangkat lunak Molekular Docking, dan Virtual Screening paling populer yang paling banyak digunakan pada dunia akademik, jumlah sitasi artikelnya saja saat ini mencapai 20179 pada Agustus 2022. Autodock Vina mampu melakukan simulasi docking sangat cepat jika dibandingkan dengan Autodock4.2. Biasanya Vina digunakan pada CMD Windows atau Terminal di Linux. Vina sangat ringan, dan tidak membutuhkan instalasi, ukuran file lebih kecil dari 3 Megabyte. Masih kurangnya buku spesifik berbahasa indonesia yang membahas AutoDock Vina serta banyak penelitian dan metode Docking yang masih tidak tepat untuk menyimpulkan hasil simulasi metode ini sehingga memacu penulis untuk menulis buku ini.
Penambatan Molekul dengan PLANTS dalam Kimia Medisinal
Buku ini merangkum teori penambatan molekul dengan memanfaatkan perangkat lunak Protein-Ligand ANT System (PLANTS), yang memfokuskan pada jenis ikatan kimia antara protein dan obat. Buku ini bukan hanya berfungsi sebagai alat pembelajaran yang berharga dalam bidang Kimia Medisinal, selain itu juga memberikan wawasan mendalam mengenai algoritma koloni semut dalam penambatan molekul dengan bantuan komputer, termasuk penggunaan Google Colab, serta penerapan teknik penambatan molekul antara obat dan pembawa (Inclusion Complexes). Dalam buku ini dibahas juga teori dasar dalam target obat dan pengembangan obat. Buku ini akan membekali pembaca dengan kemampuan untuk menguasai teknik penambatan molekul (docking) dan menghasilkan desain obat yang lebih efektif. Jadi, jika ingin memahami lebih dalam tentang bagaimana algoritma dan perangkat lunak dapat diterapkan dalam simulasi dengan menggunakan PLANTS, temukan semua jawabannya dalam buku ini.
Simulasi Molekuler pada Bidang Pangan Fungsional
Author: Agus Susilo
language: id
Publisher: Universitas Brawijaya Press
Release Date: 2023-12-31
Molecular Docking adalah simulasi komputer untuk memprediksi interaksi protein dan ligannya. Metode ini sering kali digabungkan dengan simulasi dinamika molekuler untuk mempelajari dinamika sebuah sistem molekul pada kondisi yang telah ditentukan. Penggunaan docking dapat diterapkan dalam bidang pangan fungsional. Meskipun pada dasarnya metode komputasi tidak mudah untuk pemula, sudah ada beberapa perangkat lunak yang dapat digunakan berkat tampilan antarmuka yang ramah pengguna. Buku ini menjelaskan bagaimana prinsip dasar dan tutorial melakukan analisis docking menggunakan perangkat lunak Autodock Vina, PyRx, Discovery Studio Visualizer, serta simulasi dinamika molekuler menggunakan YASARA. Dengan tampilan antarmuka dan urutan langkah demi langkah yang runtut, kami mengharapkan pembaca dengan kategori pemula dalam bidang biologi komputasi dapat mengikuti setiap tahapannya dengan mudah.